Potomac Photonics unterstützt das New YorkGenome Center bei der Bekämpfung des Klimawandels
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Potomac Photonics unterstützt das New Yorker
Genome Center im Kampf gegen den Klimawandel

Potomac Photonics | Juni 17, 2022

Kleine Löcher im Objektträger. Lochdurchmesser im Bild sind 200um, 500um und 1mm.

Heute entwickelt eine neue Generation von Wissenschaftlern und Ingenieuren, die nicht unbedingt direkt mit dem Klimawandel zu tun haben, aktiv Wege, um ihren Kohlenstoff-Fußabdruck in der Welt zu verringern. Kunal Pandit und Joana Petrescu vom New Yorker Genome Center sind Beispiele für diese sozial bewussten Weltbürger, die versuchen, die Auswirkungen ihrer Arbeit auf unseren Planeten zu verändern.

Wiederverwendung von Werkzeugen der Genomsequenzierung

Das Illumina HiSeq 2500 war ein Arbeitspferd der Genomsequenzierung, aber wie bei vielen Labormaschinen wurden neue Modelle entwickelt, um die Leistung zu verbessern. Was macht ein Forschungszentrum mit veralteten Geräten, die vom Hersteller nicht mehr unterstützt werden?

Kunal und Joana erkannten, dass diese großen, schweren Maschinen eine Menge guter Werkzeuge enthielten, und dass es nicht ihrem sozialen Bewusstsein entsprach, sie auf die Müllhalde zu schicken. Also suchten sie nach Möglichkeiten, ein einst wertvolles Werkzeug in einem Bereich zu einer Open-Source-Plattform für Mikrofluidik und Bildgebung umzuwidmen.

Kleine Löcher im Glas

Die Schaffung der 4i-Innovation

Das Team entwickelte schließlich ein automatisiertes Protokoll für die Hi-Plex-Färbung und Bildgebung intakter Gewebeschnitte unter Verwendung eines Verfahrens namens 4i. Kunal und Joana entwickelten ein automatisiertes Protokoll für die Hochplex-Färbung und Bildgebung intakter Gewebeschnitte unter Verwendung der iterativen indirekten Immunfluoreszenz-Bildgebung, daher der Name.

Das Team des New York Genome Center schrieb einen neuen Code, um den Controller zu aktualisieren, entwarf eine neue Fließzelle, die die Abbildung neuer Materialien ermöglichte, und entwickelte weitere Elemente, die den Aufbau eines Multiplex-Bildes ermöglichten.

Potomac-Beitrag

Während das System bereits über ein Mikroskop und mikrofluidische Funktionen verfügte, musste für das neue Design etwas um den Objektträger herum gebaut werden, in das Präzisionslöcher gebohrt wurden, um eine genaue Platzierung zu gewährleisten. Die Löcher mussten für das bestehende System ausgerichtet werden, um ein Vakuum zu erzeugen, was für den Prozess entscheidend war.

Das Team hatte sich an eine Reihe von Anbietern gewandt, und laut Kunal war "niemand in der Lage, die Platzierung genau genug für unsere Bedürfnisse zu gestalten." Bis sie Potomac fanden. Durch die iterative Zusammenarbeit mit den Potomac-Konstrukteuren konnten die engen Parameter erreicht werden.

Das Substrat war Glas, und Kunal gab zu, dass sie selbst intern nicht genau messen konnten. Indem sie den Maschinenteil nach Potomac schickten, konnten beide Teams das Design optimieren und ein wiederholbares Teil, NYGC-4, entwickeln.

Das Fachwissen von Potomac im Bereich der Metrologie ist der Schlüssel für die Arbeit in den kleinen räumlichen Maßstäben, die in der Genomsequenzierung, der Mikrofluidik, der Biotechnologie, der Mikroelektronik und anderen Branchen zur Miniaturisierung von Produkten für die Märktedes 21.

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