Pequeños orificios en el portaobjetos del microscopio. Los diámetros de los orificios en la imagen son 200 um, 500 um y 1 mm.
En la actualidad, una nueva generación de científicos e ingenieros, que no necesariamente trabajan directamente en el ámbito del cambio climático, están desarrollando activamente formas de reducir su huella de carbono en el mundo. Kunal Pandit y Joana Petrescu, del Centro Genómico de Nueva York, son ejemplos de estos ciudadanos del mundo con conciencia social que buscan modificar el impacto de su trabajo en nuestro planeta.
Reutilización de herramientas de secuenciación del genoma
El Illumina HiSeq 2500 ha sido un caballo de batalla en la secuenciación genómica, pero, como ocurre con muchas máquinas de laboratorio, se desarrollaron nuevos modelos para mejorar el rendimiento. ¿Qué hace un centro de investigación con herramientas obsoletas que ya no reciben soporte del fabricante?
Kunal y Joana reconocieron que estas máquinas grandes y pesadas tenían muchas herramientas útiles en su interior y que verlas terminar en un vertedero no coincidía con su conciencia social. Por eso, buscaron formas de reutilizar una herramienta que alguna vez fue valiosa en un área para convertirla en una plataforma de código abierto para la microfluídica y la obtención de imágenes.
Creando la Innovación 4i
El equipo desarrolló finalmente un protocolo automatizado para la tinción de hi-plex y la obtención de imágenes de secciones de tejido intacto utilizando un proceso llamado 4i. Kunal y Joana desarrollaron un protocolo automatizado para la tinción de hi-plex y la obtención de imágenes de secciones de tejido intacto utilizando imágenes de inmunofluorescencia indirecta iterativas, de ahí el nombre.
El equipo del Centro del Genoma de Nueva York escribió un nuevo código para actualizar el controlador, diseñó una nueva celda de flujo que permitió obtener imágenes de nuevos materiales y desarrolló otros elementos que permitieron construir una imagen multiplex.
Contribución del Potomac
Si bien el sistema ya tenía incorporado un microscopio y capacidad microfluídica, el nuevo diseño necesitaba algo construido alrededor del portaobjetos de vidrio con orificios de precisión perforados para garantizar una colocación precisa. Los orificios debían estar alineados con el sistema existente para generar el vacío, que era clave para el proceso.
El equipo se había puesto en contacto con varios proveedores y, según Kunal, "nadie pudo conseguir la ubicación lo suficientemente precisa para nuestras necesidades". Hasta que encontraron a Potomac. Trabajando de forma iterativa con los ingenieros de diseño de Potomac, se lograron los parámetros ajustados.
El sustrato era de vidrio y Kunal admitió que ni siquiera internamente podían medir con precisión. Al enviar la plataforma de la máquina a Potomac, ambos equipos pudieron optimizar el diseño y crear una pieza repetible, NYGC-4.
La experiencia de Potomac en metrología es clave para trabajar en las pequeñas escalas espaciales necesarias en la secuenciación del genoma, la microfluídica, la biotecnología, la microelectrónica y más industrias que miniaturizan productos para los mercados del siglo XXI .
