Piccoli fori nel vetrino del microscopio. I diametri dei fori in foto sono 200um, 500um e 1mm.
Oggi, una nuova generazione di scienziati e ingegneri, che non necessariamente lavorano direttamente sul cambiamento climatico, sta attivamente sviluppando modi per ridurre la propria impronta di carbonio nel mondo. Kunal Pandit e Joana Petrescu del New York Genome Center sono esempi di questi cittadini del mondo socialmente consapevoli che cercano di modificare l'impatto del loro lavoro sul nostro pianeta.
Riutilizzo degli strumenti di sequenziamento del genoma
Illumina HiSeq 2500 è stato un cavallo di battaglia del sequenziamento del genoma, ma come molte macchine da laboratorio, sono stati sviluppati nuovi modelli per migliorare le prestazioni. Cosa fa un centro di ricerca con strumenti obsoleti che non sono più supportati dal produttore?
Kunal e Joana hanno capito che queste grandi e pesanti macchine avevano al loro interno molti buoni utensili e vederli finire in discarica non era in linea con la loro coscienza sociale. Quindi, hanno cercato dei modi per riutilizzare uno strumento un tempo prezioso in un'area, trasformandolo in una piattaforma open source per la microfluidica e l'imaging.
Creare l'innovazione 4i
Il team ha infine sviluppato un protocollo automatizzato per la colorazione hi-plex e l'imaging di sezioni di tessuto intatte utilizzando un processo chiamato 4i. Kunal e Joana hanno sviluppato un protocollo automatizzato per la colorazione hi-plex e l'imaging di sezioni di tessuto intatte utilizzando l'imaging di immunofluorescenza indiretta iterativa, da cui il nome.
Il team del New York Genome Center ha scritto un nuovo codice per aggiornare il controller, ha progettato una nuova cella di flusso che ha consentito l'imaging di nuovi materiali e ha sviluppato altri elementi che hanno consentito di creare un'immagine multiplex.
Contributo del Potomac
Mentre il sistema aveva già un microscopio e una capacità microfluidica incorporati, il nuovo design necessitava di qualcosa costruito attorno al vetrino con fori di precisione che garantissero un posizionamento accurato. I fori dovevano essere allineati per il sistema esistente per creare un vuoto che era fondamentale per il processo.
Il team aveva contattato diversi fornitori e, secondo Kunal, "nessuno era riuscito a ottenere un posizionamento sufficientemente accurato per le nostre esigenze". Finché non hanno trovato Potomac. Lavorando in modo iterativo con gli ingegneri di progettazione di Potomac, sono stati raggiunti i rigidi parametri.
Il substrato era di vetro e Kunal ammise che anche internamente non riuscivano a misurare con precisione. Inviando il palco della macchina a Potomac, entrambi i team riuscirono a ottimizzare il design e a creare una parte ripetibile, NYGC-4.
La competenza di Potomac nel campo della metrologia è essenziale per lavorare sulle piccole scale spaziali richieste nel sequenziamento del genoma, nella microfluidica, nella biotecnologia, nella microelettronica e in altri settori che miniaturizzano i prodotti per i mercati del 21 ° secolo.
